Образовательная программа рассчитана на лиц, получивших высшее медицинское образование и направлена на подготовку высококвалифицированных специалистов. Обучение носит практико-ориентированный характер и нацелено на формирование системных знаний и профессиональных компетенций, позволяющих осуществлять лечебную деятельность в рамках хирургической стоматологии. За два года обучения ординатор осваивает ряд дисциплин с последующим контролем полученных знаний. В учебную программу включены два блока: образовательные дисциплины и практика. Учебные и лекционные аудитории  оснащены оборудованием, позволяющим использовать симуляционные технологии с типовыми наборами профессиональных моделей и результатами лабораторных и инструментальных исследований в количестве, позволяющем обучающимся осваивать умения и навыки, предусмотренные профессиональной деятельностью.

Отработка практических навыков ординатора производится на протяжении всего обучения. Начальный этап представляет собой отработку манипуляций в рамках симмуляционных курсов. Отработав навыки на фантомах, ординаторы распределяются в стоматологические отделения, где под руководством профессоров кафедры имеют возможность не только расширить свои знания, но и увидеть их применение на практике.